油菜（Brassica napus L.），草本十字花科作物，是我国主要油料作物和蜜源作物之一，其籽粒是制浸油脂原料主要品种之一。油菜栽培遍及全国，其种植面积占全国油料作物总面积的40%以上，产量占全国油料总产量的30%以上，居世界首位。虽然已知油菜会受涝的影响，但是对其耐涝的遗传基础却不甚了解，对油菜进行耐涝机制的研究在农业与经济上都具有重大意义。近期，中国农业科学院油料作物研究所张学昆研究员，领衔其团队对油菜出苗期根受涝情况下的转录组进行了系统比较研究*，研究成果发表在International Journal of Molecular Sciences上。

      研究人员利用数字基因表达谱测序技术（DGE-Seq），对ZS9（一个耐涝品种）的根在水淹0 h和12h后测其转录组（联川生物提供DGE-Seq服务）。共鉴定得到4432个差异表达的基因，表明油菜的涝应答过程非常复杂。基于GO注释基因揭示更多的基因在受涝情况下被诱导，包括“氧化还原”，“次级代谢”，“转录调控”，以及 “翻译调控”，表明这四条通路在水淹过程中得到增强。对200个表达丰度最高的基因进行分析，揭示在正常条件下144个基因受涝影响下调，而在水淹条件下多达191个被诱导应答胁迫。涝相关基因的表达，受转录水平，转录后水平，翻译和翻译后调节等多个水平的调控，包括磷酸化和蛋白质的降解，特别是蛋白质的降解，可能参与此应激反应的负调控。

      本研究结果为油菜的涝应答提供了新的见解，并将有助于确定重要的候选基因。

* Zou X, Tan X, Hu C, Zeng L, Lu G, Fu G, Cheng Y, Zhang X.(2013) The Transcriptome of Brassica napus L. Roots under Waterlogging at the Seedling Stage. Int J Mol Sci. 28;14(2):2637-51.[abstract]

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