环境微生物群落多样性分析,基于Roche 454 FLX +、Illumina MiSeq等第二代高通量测序平台,对核糖体RNA高变区域,比如16S/18S/ITS等序列;或功能基因,比如细菌和古菌的氨氧化酶基因进行测序,揭示环境样品中众多不同类型微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系。
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酵母菌作为分子生物学研究的重要工具,基因组注释明确,各种基因操作手段成熟。作为传统的模式生物,为了满足不同科研工作的需求,酵母菌基因组改造技术应运而生
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鸟枪法战略(Shotgun Strategy)又称随机测序战略,是由美国塞莱拉遗传公司创始人克雷格•文特尔发明,主要针对大片段的全长测序
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TA克隆技术(TA cloning)利用Taq聚合酶具有末端转移酶(TdT)活性,但却不具有3''''-5''''端外切酶校准活性的特点,可在PCR产物的3''''端加上一个非模板依赖碱基“A”。
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传统的真菌分类鉴定主要是按照真菌的形态、生长以及生理生化等特征对真菌进行分类。然而真菌的种类繁多,个体多态性明显,而且其生长、生理生化特征也会随着环境的变化而不稳定。因此,采用传统的方法对真菌进行正确的分类存在较大的困难。
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技术特点1. 原理简单,容易掌握,适合短基因片段的SNP筛查。2. 检出率接近100%。3. 可以发现新的SNP位点。
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MiSeq测序系统采用Illumina成熟的TruSeq边合成边测序技术,它是唯一一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪,每次运行最多能产生超过7 Gb的数据。
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MetaEnvironmental Genomics, Ecogenomics, Community Genomics环境基因组、宏基因组、元基因组…
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